Lagerkvists första betydande verk, diktsamlingen Ångest (1916), blev banbrytande för den lyriska modernismen i Sverige. Av Lagerkvists många lyriska verk brukar Aftonland (1953) ses som det främsta. Här behandlar Lagerkvist centrala livsfrågor som sökandet efter den osynlige guden och livets mening. Kring dessa temata kretsar större delen av författarskapet. Ett tidigt exempel är den expressionistiska enaktaren Himlens hemlighet (1919), Lagerkvists första betydande drama.
I flera prosaverk protesterar Lagerkvist mot världens ondska och människors grymhet, t.ex. i Bödeln (1933) där nazismen kritiseras och i den historiska romanen Dvärgen (1944). Ett av Lagerkvists viktigaste verk är romanen Barabbas (1950), som behandlar frågorna om Gud och livet. Trons problem fokuseras även i Pär Lagerkvists stora romansvit Sibyllan (1956), Ahasverus död (1960), Pilgrim på havet (1962) och Det heliga landet (1964).